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CDH1 mutations in gastric cancer patients from northern Brazil identified by Next- Generation Sequencing (NGS)
(Universidade Federal do Pará, 2016-06) EL HUSNY, Antonette Souto; MORAES, Milene Raiol de; AMADOR, Marcos Antônio Trindade; SANTOS, André Maurício Ribeiro dos; MONTAGNINI, Andre Luis; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; SILVA, Artur Luiz da Costa da; ASSUMPÇÃO, Paulo Pimentel de; ISHAK, Geraldo; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; PINTO, Pablo Diego do Carmo; CRUZ, Aline Maria Pereira; SANTOS, Ândrea Kely Campos Ribeiro dos
Acesso aberto (Open Access)
CMRegNet–An interspecies reference database for corynebacterial and mycobacterial regulatory networks
(BioMed Central Ltd, 2015-06) ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ALMEIDA, Sintia Silva de; TIWARI, Sandeep; HASSAN, Syed Shah; MARIANO, Diego César Batista; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BAUMBACH, Jan; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; RÖTTGER, Richard
Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technology
(BioMed Central, 2012) HASSAN, Syed Shah; GUIMARÃES, Luís Carlos; PEREIRA, Ulisses de Pádua; ISLAM, Arshad; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; RIBEIRO, Dayana; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; ALMEIDA, Sintia Silva de; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ABURJAILE, Flavia Figueira; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; CERDEIRA, Louise Teixeira; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ROCHA, Flávia de Souza; RAMOS, Rommel Thiago Juca; JAIN, Neha; TIWARI, Sandeep; BARH, Debmalya; MIYOSHI, Anderson; MÜLLER, Borna; SILVA, Artur Luiz da Costa da; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I19, a strain isolated from a cow in Israel with bovine mastitis
(American Society for Microbiology, 2011-01) SILVA, Artur Luiz da Costa da; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; CERDEIRA, Louise Teixeira; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; OLIVEIRA, Rodrigo Santos de; LIMA, Margarida Maria Celeira de; CONCEIÇÃO, Marília Lima da; FERREIRA, Vívian D'Afonseca da Silva; ALMEIDA, Sintia Silva de; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; ALI, Amjad; DORELLA, Fernanda Alves; ROCHA, Flávia de Souza; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; TROST, Eva; TAUCH, Andreas; SHPIGEL, Nahum; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 1/06-A, Isolated from a Horse in North America
(American Society for Microbiology, 2012-08) PETHICK, Florence E.; LAINSON, Alex F.; YAGA, Raja; FLOCKHART, Allen; SMITH, David G. E.; DONACHIE, Willie; CERDEIRA, Louise Teixeira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BOL, Erick Johny Maciel; LOPES, Thiago Souza; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABURJAILE, Flavia Figueira; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; PEREIRA, Ulisses de Pádua; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; DORELLA, Fernanda Alves; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ROCHA, Flávia de Souza; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; FONTAINE, Michael C.
Acesso aberto (Open Access)
Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp267, Isolated from a Llama
(American Society for Microbiology, 2012-07) LOPES, Thiago Souza; SILVA, Artur Luiz da Costa da; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; DORELLA, Fernanda Alves; ROCHA, Flávia de Souza; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; LIMA, Alex Ranieri Jerônimo; GUIMARÃES, Luís Carlos; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ALMEIDA, Sintia Silva de; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; ABURJAILE, Flavia Figueira; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SOARES, Siomar de Castro; PEREIRA, Ulisses de Pádua; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; EDMAN, Judy; SPIER, Sharon; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354
(American Society for Microbiology, 2011-10) STYNEN, Ana Paula Reinato; LAGE, Andrey Pereira; MOORE, Robert J.; REZENDE, Antonio Mauro; FERREIRA, Vívian D'Afonseca da Silva; RUY, Patrícia de Cássia; OLIVEIRA, Nesley Jesus Daher de; RESENDE, Daniela de Melo; ALMEIDA, Sintia Silva de; SOARES, Siomar de Castro; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ROCHA, Aryane Aparecida Magalhães Cassiano; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; COUTO, Danielle Costa Carrara; DORELLA, Fernanda Alves; MIYOSHI, Anderson; LIMA, Alex Ranieri Jerônimo; CAMPOS, Frederico Davi da Silva; SÁ, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de; LOPES, Thiago Souza; RODRIGUES, Ryan Maurício Araújo; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; LEÃO, Tiago Ferreira; CERDEIRA, Louise Teixeira; RAMOS, Rommel Thiago Juca; SILVA, Artur Luiz da Costa da; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; RUIZ, Jeronimo Conceição
Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequences of Corynebacterium pseudotuberculosis Strains 3/99-5 and 42/02-A, isolated from sheep in Scotland and Australia, respectively
(American Society for Microbiology, 2012-09) PETHICK, Florence E.; LAINSON, Alex F.; YAGA, Raja; FLOCKHART, Allen; SMITH, David G. E.; DONACHIE, Willie; CERDEIRA, Louise Teixeira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BOL, Erick Johny Maciel; LOPES, Thiago Souza; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABURJAILE, Flavia Figueira; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; PEREIRA, Ulisses de Pádua; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; DORELLA, Fernanda Alves; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ROCHA, Flávia de Souza; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; FONTAINE, Michael C.
Acesso aberto (Open Access)
Diversidade genética e eficiência de DNA microssatélites para o controle genealógico da raça Nelore
(2007-10) CARNEIRO, Thomaz Xavier; GONÇALVES, Evonnildo Costa; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, Artur Luiz da Costa da
Foram estimados na raça Nelore a variabilidade genética e os valores de determinação de paternidade usando-se 11 marcadores microssatélites do painel ISAG/FAO. Estes foram organizados em quatro conjuntos de amplificação para genotipagem semi-automática por fluorescência. Todos os marcadores apresentaram-se altamente polimórficos, com média de 8,2 alelos por loco. A heterozigosidade observada, com média de 0,48, foi menor que a esperada em 10 locos. Foram observadas deficiências de heterozigotos em nove locos, o que resultou no desequilíbrio de Hardy-Weinberg para a população estudada. O conteúdo polimórfico informativo foi superior a 0,5 em 10 locos. O poder de discriminação foi >0,999 e as probabilidades de exclusão de paternidade quando são conhecidos os genótipos de um bezerro, sua mãe e um pai alegado, ou quando um ou outro genótipo parental não está disponível, para o conjunto de marcadores foram >0,999 e >0,989, respectivamente. O conjunto de 11 marcadores constitui método eficiente para a determinação de paternidade na raça Nelore.
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Diversity and three-dimensional structures of the alpha Mcr of the methanogenic Archaea from the anoxic region of Tucuruí Lake, in Eastern Brazilian Amazonia
(2012-01) SANTANA, Priscila di Paula Bessa; GHILARDI JUNIOR, Rubens; ALVES, Claudio Nahum; SILVA, Jeronimo Lameira; MCCULLOCH, John Anthony; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, Artur Luiz da Costa da
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Draft genome sequences of two species of “difficult-to-identify” human-pathogenic corynebacteria: implications for better identification tests.
(Ivyspring International Publisher, 2015) PACHECO, Luis Gustavo Carvalho; GUARALDI, Ana Luiza de Mattos; SANTOS, Carolina Silva; VERAS, Adonney Allan de Oliveira; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; PEREIRA, Felipe Luiz; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; CARVALHO, Alex Fiorini de; LEAL, Carlos Augusto Gomes; FIGUEIREDO, Henrique Cesar Pereira; RAMOS, Juliana Nunes; VIEIRA, Verônica Viana; FARFOUR, Eric; GUISO, Nicole; HIRATA JÚNIOR, Raphael; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; SILVA, Artur Luiz da Costa da; RAMOS, Rommel Thiago Juca
Acesso aberto (Open Access)
Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains
(Public Library of Science, 2011-04) RUIZ, Jeronimo Conceição; FERREIRA, Vívian D'Afonseca da Silva; SILVA, Artur Luiz da Costa da; ALI, Amjad; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; ROCHA, Aryane Aparecida Magalhães Cassiano; DORELLA, Fernanda Alves; PACHECO, Luis Gustavo Carvalho; COSTA, Marcilia Pinheiro da; TURK, Meritxell Zurita; SEYFFERT, Núbia; MORAES, Pablo Matias Ribeiro de Oliveira; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; CASTRO, Thiago Luiz de Paula; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; TROST, Eva; BAUMBACH, Jan; TAUCH, Andreas; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MCCULLOCH, John Anthony; CERDEIRA, Louise Teixeira; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ZERLOTINI NETO, Adhemar; DOMINITINI, Anderson Joaquim; RESENDE, Daniela de Melo; COSER, Elisângela Monteiro; OLIVEIRA, Luciana Márcia de; PEDROSA, André Luiz; VIEIRA, Carlos Ueira; GUIMARÃES, Claudia Teixeira; BARTHOLOMEU, Daniela C.; OLIVEIRA, Diana Magalhães de; SANTOS, Fabrício Rodrigues dos; RABELO, Elida Mara Leite; LOBO, Francisco Pereira; FRANCO, Gloria Regina; COSTA, Ana Flávia Dias Vieira da
Acesso aberto (Open Access)
Exoproteome and Secretome Derived Broad Spectrum Novel Drug and Vaccine Candidates in Vibrio cholerae Targeted by Piper betel Derived Compounds
(Public Library of Science, 2013-01) BARH, Debmalya; SHARMA, Neha Barve; GUPTA, Krishnakant; CHANDRA, Sudha; JAIN, Neha; TIWARI, Sandeep; LEON-SICAIROS, Nidia; CANIZALEZ-ROMAN, Adrian; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; HASSAN, Syed Shah; ALMEIDA, Sintia Silva de; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; SOARES, Siomar de Castro; CASTRO, Thiago Luiz de Paula; MIYOSHI, Anderson; SILVA, Artur Luiz da Costa da; KUMAR, Anil; NARAYAN MISRA, Amarendra; BLUM, Kenneth; BRAVERMAN, Eric R.; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Exposure to an extremely low-frequency electromagnetic field only slightly modifies the proteome of Chromobacterium violaceum ATCC 12472
(2015-06) BARAÚNA, Rafael Azevedo; SANTOS, Agenor Valadares; GRAÇAS, Diego Assis das; SANTOS, Daniel Moreira dos; GHILARDI JUNIOR, Rubens; PIMENTA, Adriano Monteiro de Castro; CAREPO, Marta Sofia Peixe; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, Artur Luiz da Costa da
Acesso aberto (Open Access)
Genetic structure of red-handed howler monkey populations in the fragmented landscape of Eastern Brazilian Amazonia
(2010) BASTOS, Heitor Burlamaqui; GONÇALVES, Evonnildo Costa; FERRARI, Stephen Francis; SILVA, Artur Luiz da Costa da; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz
Acesso aberto (Open Access)
Genetic variability and efficiency of DNA microsatellite markers for paternity testing in horse breeds from the Brazilian Marajó archipelago
(2008) REIS, Sávio Pinho dos; GONÇALVES, Evonnildo Costa; SILVA, Artur Luiz da Costa da; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz
Acesso aberto (Open Access)
Genome sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA - producing strain
(American Society for Microbiology, 2014-10) SARAIVA, Tessália Diniz Luerce; SOARES, Siomar de Castro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; SÁ, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; MIRANDA, Fábio Malcher; FREIRA, Matheus; RENAN, Wendal; OLIVEIRA JÚNIOR, Alberto Fernandes de; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SOUZA, Bianca Mendes; CASTRO, Camila Prósperi de; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ROCHA, Clarissa Santos; MARIANO, Diego César Batista; AGUIAR, Edgar Lacerda de; FOLADOR, Edson Luiz; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; ABURJAILE, Flavia Figueira; GONÇALVES, Lucas Amorim; GUIMARÃES, Luís Carlos; AZEVEDO, Marcela; AGRESTI, Pamela Mancha; SOUZA, Renata de Faria Silva; TIWARI, Sandeep; ALMEIDA, Sintia Silva de; HASSAN, Syed Shah; PEREIRA, Vanessa Bastos; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; PEREIRA, Ulisses de Pádua; DORELLA, Fernanda Alves; CARVALHO, Alex Fiorini de; PEREIRA, Felipe Luiz; LEAL, Carlos Augusto Gomes; FIGUEIREDO, Henrique Cesar Pereira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Lack of evidence for human infection with Xenotropic murine leukemia virus-related virus in the Brazilian Amazon basin
(2014-06) GOMES, Samara Tatielle Monteiro; IMBIRIBA, Luciana; BURBANO, Rommel Mario Rodriguéz; SILVA, Artur Luiz da Costa da; FEITOSA, Rosimar Neris Martins; VALLINOTO, Izaura Maria Vieira Cayres; ISHAK, Marluísa de Oliveira Guimarães; ISHAK, Ricardo; VALLINOTO, Antonio Carlos Rosário
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PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software
(Public Library of Science, 2012-02) SOARES, Siomar de Castro; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CERDEIRA, Louise Teixeira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BAUMBACH, Jan; TROST, Eva; TAUCH, Andreas; HIRATA JÚNIOR, Raphael; GUARALDI, Ana Luiza de Mattos; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Proteome scale comparative modeling for conserved drug and vaccine targets identification in Corynebacterium pseudotuberculosis
(BioMed Central Ltd, 2014) HASSAN, Syed Shah; TIWARI, Sandeep; GUIMARÃES, Luís Carlos; BACHA, Syed Babar Jamal; FOLADOR, Edson Luiz; SHARMA, Neha Barve; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; ALI, Amjad; ISLAM, Arshad; PÓVOA, Fabiana Dias; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; JAIN, Neha; FERREIRA, Rafaela Salgado; BHATTACHARYA, Antaripa; JUNEJA, Lucky; MIYOSHI, Anderson; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BARH, Debmalya; TURJANSKI, Adrian Gustavo; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho