ICB - Instituto de Ciências Biológicas

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Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technology
(BioMed Central, 2012) HASSAN, Syed Shah; GUIMARÃES, Luís Carlos; PEREIRA, Ulisses de Pádua; ISLAM, Arshad; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; RIBEIRO, Dayana; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; ALMEIDA, Sintia Silva de; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ABURJAILE, Flavia Figueira; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; CERDEIRA, Louise Teixeira; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ROCHA, Flávia de Souza; RAMOS, Rommel Thiago Juca; JAIN, Neha; TIWARI, Sandeep; BARH, Debmalya; MIYOSHI, Anderson; MÜLLER, Borna; SILVA, Artur Luiz da Costa da; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I19, a strain isolated from a cow in Israel with bovine mastitis
(American Society for Microbiology, 2011-01) SILVA, Artur Luiz da Costa da; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; CERDEIRA, Louise Teixeira; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; OLIVEIRA, Rodrigo Santos de; LIMA, Margarida Maria Celeira de; CONCEIÇÃO, Marília Lima da; FERREIRA, Vívian D'Afonseca da Silva; ALMEIDA, Sintia Silva de; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; ALI, Amjad; DORELLA, Fernanda Alves; ROCHA, Flávia de Souza; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; TROST, Eva; TAUCH, Andreas; SHPIGEL, Nahum; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 1/06-A, Isolated from a Horse in North America
(American Society for Microbiology, 2012-08) PETHICK, Florence E.; LAINSON, Alex F.; YAGA, Raja; FLOCKHART, Allen; SMITH, David G. E.; DONACHIE, Willie; CERDEIRA, Louise Teixeira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BOL, Erick Johny Maciel; LOPES, Thiago Souza; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABURJAILE, Flavia Figueira; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; PEREIRA, Ulisses de Pádua; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; DORELLA, Fernanda Alves; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ROCHA, Flávia de Souza; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; FONTAINE, Michael C.
Acesso aberto (Open Access)
Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp267, Isolated from a Llama
(American Society for Microbiology, 2012-07) LOPES, Thiago Souza; SILVA, Artur Luiz da Costa da; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; DORELLA, Fernanda Alves; ROCHA, Flávia de Souza; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; LIMA, Alex Ranieri Jerônimo; GUIMARÃES, Luís Carlos; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ALMEIDA, Sintia Silva de; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; ABURJAILE, Flavia Figueira; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SOARES, Siomar de Castro; PEREIRA, Ulisses de Pádua; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; EDMAN, Judy; SPIER, Sharon; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho
Acesso aberto (Open Access)
Complete genome sequences of Corynebacterium pseudotuberculosis Strains 3/99-5 and 42/02-A, isolated from sheep in Scotland and Australia, respectively
(American Society for Microbiology, 2012-09) PETHICK, Florence E.; LAINSON, Alex F.; YAGA, Raja; FLOCKHART, Allen; SMITH, David G. E.; DONACHIE, Willie; CERDEIRA, Louise Teixeira; SILVA, Artur Luiz da Costa da; BOL, Erick Johny Maciel; LOPES, Thiago Souza; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; ALMEIDA, Sintia Silva de; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABURJAILE, Flavia Figueira; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; RIBEIRO, Dayana; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; PEREIRA, Ulisses de Pádua; HASSAN, Syed Shah; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; DORELLA, Fernanda Alves; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; ROCHA, Flávia de Souza; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; FONTAINE, Michael C.
Acesso aberto (Open Access)
Draft genome sequences of two species of “difficult-to-identify” human-pathogenic corynebacteria: implications for better identification tests.
(Ivyspring International Publisher, 2015) PACHECO, Luis Gustavo Carvalho; GUARALDI, Ana Luiza de Mattos; SANTOS, Carolina Silva; VERAS, Adonney Allan de Oliveira; GUIMARÃES, Luís Carlos; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; PEREIRA, Felipe Luiz; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; CARVALHO, Alex Fiorini de; LEAL, Carlos Augusto Gomes; FIGUEIREDO, Henrique Cesar Pereira; RAMOS, Juliana Nunes; VIEIRA, Verônica Viana; FARFOUR, Eric; GUISO, Nicole; HIRATA JÚNIOR, Raphael; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; SILVA, Artur Luiz da Costa da; RAMOS, Rommel Thiago Juca
Acesso aberto (Open Access)
Ecological studies of mayflies (Insecta, Ephemeroptera): can sampling effort be reduced without losing essential taxonomic and ecological information?
(Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, 2018-06) SHIMANO, Yulie; MATOS, Mylena Neves Cardoso; JUEN, Leandro
O presente estudo avaliou o potencial para redução do esforço amostral em estudos com ninfas de Ephemeroptera em igarapés amazônicos, no estado do Pará, Brasil, sem perder informações ecológicas (composição de espécies, abundância e riqueza), além de verificar se existe congruência entre diferentes níveis de resolução taxonômica (morfoespécie, gênero, família e grupo funcional). Grupos reduzidos de 15, 10 e cinco subamostras de um controle de 20 amostras de cada um dos 40 igarapés amostrados, foram comparados quanto a riqueza de táxons e abundância (ANOVA) e composição (Procrustes). A resolução taxonômica também foi avaliada através do Procrustes. A abundância (F(3, 156) = 25,426; p < 0,001) e riqueza (F(3, 156) = 13,866, p < 0,001) variaram significativamente entre os grupos de amostras, porém, os resultados tanto de riqueza quanto de abundância dos grupos 15-S foram estatisticamente similares aos de 20-S. O mesmo padrão foi encontrado para riqueza de espécies. A resolução taxonômica a nível de gênero obteve 99% de congruência com a de morfoespécie. Esses resultados indicam que a diminuição de 20 subamostras para 15, e a redução da identificação de morfoespécie para gênero não afetaria a significância das análises. A redução de cinco amostras por local de coleta poderia resultar em uma diminuição do esforço em campo e do material para ser processado em laboratório, reduzindo o tempo de triagem e identificação. Ainda, para reduzir tempo e recursos financeiros gastos para coleta e identificação dos organismos, a identificação apenas a nível genérico poderia minimizar erros de sub ou super estimativa no processamento dos resultados.
Acesso aberto (Open Access)
Effects of marginal vegetation removal on Odonata communities
(Associação Brasileira de Limnologia, 2013-03) CARVALHO, Fernando Geraldo de; PINTO, Nelson Silva; OLIVEIRA JUNIOR, José Max Barbosa de; JUEN, Leandro
OBJETIVOS: Com o intuito de avaliar os efeitos de mudanças na integridade ambiental sobre os indivíduos da comunidade de Odonata da sub-bacia do rio Borecaia, testamos a hipótese de que a riqueza de Anisoptera seria afetada positivamente pela remoção da vegetação; por outro lado, a riqueza Zygoptera seria prejudicada em virtude de suas necessidades ecofisiológicas; MÉTODOS: Selecionamos 10 riachos de ordens similares, seis classificados como preservados e quatro como alterados. Riachos classificados como preservados apresentaram valores do Índice valores de Integridade Habitat (HII) acima de 0.70 e mata continua nas duas margens com uma largura mínima de 70 metros. Cada ponto foi amostrado três vezes em dias diferentes. O efeito de remoção de vegetação sobre a riqueza foi avaliada utilizando Jackknife de primeira ordem; RESULTADOS: A diminuição da integridade física (mensurada com o IIH) dos córregos não exerceu efeito significativo sobre a riqueza estimada para a Ordem Odonata. Porém, a riqueza estimada de Anisoptera apresentou uma relação inversa com a integridade (r2 = 0.485; p = 0.025), mostrando que com o aumento da integridade houve uma redução na sua riqueza de espécies; DISCUSSÃO: Como um padrão geral, Anisoptera apresenta maiores valores de riqueza em locais alterados; por outro lado, Zygoptera apresenta maiores valores em preservados. Devido suas restrições ecofisiologicas Odonata apresentou uma grande variação na sua composição e riqueza de espécie entre os dois tipos de ambientes, isso reforça o potencial da ordem em estudos de monitoramento ambiental e também mostra que Zygoptera será mais afetada pelas transformações de habitat. No entanto, futuros estudos incluindo mais amostras e diferentes córregos são necessários para confirmar este padrão sendo uma linha de pesquisa interessante para trabalhos futuros.
Acesso aberto (Open Access)
Fatores de risco cardiovascular e fatores associados em escolares do Município de Belém, Pará, Brasil
(Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, 2014-03) RIBAS, Simone Augusta; SILVA, Luiz Carlos Santana da
Este estudo transversal visou a identificar fatores de risco para doença cardiovascular em uma amostra, estratificada por conglomerados, de 557 escolares (6-19 anos) de Belém, Pará, Brasil. Os fatores de risco investigados foram obesidade, hipertensão arterial, dislipidemia, diabetes, tabagismo, sedentarismo e dieta aterogênica. Variáveis sociodemográficas e relacionadas ao estilo de vida foram testadas no modelo de regressão binária logística. Os fatores de risco prevalentes foram excesso de peso (20,4%), dislipidemia (48,1%) e sedentarismo (66,2%). Constatou-se que os escolares abaixo de dez anos e os provenientes das famílias de maior renda e com maior escolaridade materna apresentaram mais chances de desenvolverem excesso de peso; por sua vez, os escolares com excesso de peso foram os mais propensos a desenvolver hipercolesterolemia e hipertrigliceredemia. Diante desse quadro, faz-se necessária, ainda na primeira infância, a implantação de estratégias para controle de excesso de peso, por meio da alimentação balanceada e da prática física regular, para que se possa reduzir de forma efetiva a prevalência de fatores de risco em escolares nesta cidade.
Desconhecido
Feeding ecology of immature Lithodoras dorsalis (Valenciennes, 1840) (Siluriformes: Doradidae) in a tidal environment, estuary of the rio Amazonas
(Sociedade Brasileira de Ictiologia, 2015-06) BARBOSA, Thiago Augusto Pedroso; BARTHEM, Ronaldo Borges; MONTAG, Luciano Fogaça de Assis
O estudo da ecologia alimentar de peixes é uma abordagem consistente na avaliação dos processos interativos dentro das comunidades. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo investigar a ecologia alimentar do bacu-pedra Lithodoras dorsalis em furos próximos no delta do estuário Amazônico (Brasil), uma área sobre influência de macro-marés, em diferentes períodos pluviométricos. Durante 12 meses de coletas (julho de 2010 a junho de 2011), foram coligidos 371 espécimes jovens, sendo que a dieta da espécie foi composta por 28 itens alimentares analisados pelos seguintes índices: Índice de Repleção Estomacal, Índice de Importância Alimentar e Amplitude de Nicho. Lithodoras dorsalis quando jovem foi classificada como herbívora com tendência à frugivoria, devido aos altos valores de importância de frutos e sementes em sua dieta. A intensidade de obtenção de alimento por L. dorsalis diferiu entre os meses de coleta, onde o final do período de transição chuva-estiagem e o início da estiagem foram os períodos de menor e maior atividade alimentar, respectivamente. Também houve diferença na importância alimentar dos itens entre os períodos pluviométricos. Estes resultados fornecem informações importantes sobre a ecologia alimentar de doradídeos na Amazônia. Além disso, percebeu-se o alto consumo de material alóctone pelo bacu-pedra, sendo estes itens alimentares provenientes da floresta ripária, o que reforça a importância deste ambiente para a conservação da ictiofauna neotropical.
Desconhecido
Feeding ecology of Serrasalmus gouldingi (Characiformes: Serrasalmidae) in the lower Anapu River region, Eastern Amazon, Brazil
(Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, 2016-09) PRUDENTE, Bruno da Silveira; MARINHO, Pedro Carneiro; VALENTE, Roberta de Melo
Estudos sobre ecologia trófica dos peixes são importantes ferramentas para compreensão das relações entre as espécies e as variações sazonais no ambiente. Em rios tropicais essas relações são modeladas principalmente por variações hidrológicas. Sendo assim, o objetivo presente estudo é avaliar a influência variação fluviométrica e do estágio de vida (juvenis e adultos) na ecologia alimentar de Serrasalmus gouldingi na região do baixo Rio Anapu, Amazônia Oriental, Pará, Brasil. Os espécimes foram amostrados bimensalmente considerando quatro períodos hidrológicos distintos. Nós avaliamos a composição da dieta, intensidade alimentar e amplitude de nicho da espécie. Foram identificados trinta e dois itens alimentares agrupados em dez categorias. Um total de 279 estômagos foi analisado, registrando um predomínio no consumo de fragmento de peixes seguido por frutos e sementes. A composição na dieta de S. gouldingi diferiu apenas entre os períodos de seca e cheia, não diferindo entre juvenis e adultos. Uma maior intensidade alimentar foi observada durante o aumento do nível dos rios, com uma menor intensidade alimentar durante os períodos transicionais. Durante o período de cheia S. gouldingi também evidenciou uma menor amplitude de nicho, a qual foi atribuída ao elevado consumo de frutos e sementes. Sendo assim, a dieta de S. gouldingi foi classificada como onívora com forte tendência a piscivoria. Embora menos evidente do que em outras regiões da Amazônia, o pulso de inundação na região do baixo Rio Anapu também afeta a ecologia alimentar da espécie.
Desconhecido
Mycological diversity description II
(Sociedade Botânica do Brasil, 2019-02-04) SILVA, Rejane Maria Ferreira da; SOARES, Adriene Mayra; PÁDUA, Ana Patrícia Sousa Lopes de; FIRMINO, André Luiz; MOTTA, Cristina Maria de Souza; SILVA, Gladstone Alves da; PLAUTZ JUNIOR, Helio Longoni; BEZERRA, Jadson Diogo Pereira; PAIVA, Laura Mesquita; OLIANI, Luisa Cunha; MÉLO, Mayara Alice Correia de; MAGALHÃES, Oliane Maria Correia; PEREIRA, Olinto Liparini; OLIVEIRA, Rafael José Vilela de; GIBERTONI, Tatiana Baptista; OLIVEIRA, Thays Gabrielle Lins de; SVEDESE, Virginia Michelle; FAN, Xinlei; RYVARDEN, Leif
Desconhecido
Puberty in male collared peccary (Pecari tajacu) determined by quantitative analysis of spermatogenic cells
(Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, 2013-03) GUIMARÃES, Diva Anelie de Araújo; CARDOSO, Deise de Lima; FERREIRA, Maria Auxiliadora Pantoja; ALBUQUERQUE, Natália Inagaki de
Estudos biológicos são necessários para o manejo da vida silvestre em cativeiro, e o conhecimento da reprodução é um dos aspectos importantes para o aumento da produção. Esta pesquisa teve como objetivo determinar a idade da puberdade do cateto macho. Foram utilizadas amostras testiculares de 15 animais, entre 7 a 16 meses, distribuídos em cinco grupos (G1, G2, G3, G4 e G5). Os testículos aumentaram no peso, comprimento e largura consideravelmente (p < 0,05) do G1 ao G3, enquanto que, a partir deste grupo, o desenvolvimento desse órgão foi mais lento. Houve correlação positiva (p < 0,001) entre os seguintes parâmetros testiculares: peso e comprimento (r = 0,97), peso e largura (r = 0,88), comprimento e largura (r = 0,92). Com relação ao diâmetro tubular, observou-se um aumento (p < 0,05) do G1 ao G4. A quantidade total de células espermatogênicas aumentou significativamente (p < 0,05) até o G3, e se estabilizou a partir deste grupo. Houve correlação positiva entre o peso testicular e o diâmetro tubular (r = 0,99, p < 0,001), bem como o peso testicular e as células espermatogênicas (r = 0,98, p < 0,001). A quantidade de células de Sertoli reduziu significativamente (p < 0,05) do G1, onde se encontravam indiferenciadas como células de suporte, até G5, onde foram observadas juntamente com todas as células da linhagem espermática. Estes resultados demonstraram que as fases do desenvolvimento reprodutivo de catetos podem ser classificadas em: impúbere (G1, 7-8 meses), pré-púbere (G2, 9-10 meses), púbere (G3, 11-12 meses), pós-púbere 1 (G4, 13-14 meses) e pós-púbere 2 (G5, 15-16 meses). Com base na análise histológica, a puberdade dos catetos machos ocorre entre 11 e 12 meses de idade.
Desconhecido
The role of Lithodoras dorsalis (Siluriformes: Doradidae) as seed disperser in Eastern Amazon
(Sociedade Brasileira de Inctiologia, 2017) BARBOSA, Thiago Augusto Pedroso; MONTAG, Luciano Fogaça de Assis
A ictiocoria é um importante processo responsável pela alta diversidade de espécies vegetais nas florestas tropicais alagadas. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo investigar o papel de Lithodoras dorsalis como dispersor de sementes na Foz Amazônica, Brasil. Analisando o conteúdo estomacal de 371 espécimes de Lithodoras dorsalis, o Potencial de Germinação (PG%) e o Índice de Velocidade de Germinação (IGS) de sementes removidas intactas foram investigados. Isto permitiu-nos avaliar o desempenho germinativo de duas importantes espécies de plantas na Amazônia, Euterpe oleracea (Açaí) e Montrichardia linifera (Aninga), após passagem pelo trato digestivo desta espécie de bagre. Dado que a digestão por L. dorsalis reduziu a viabilidade de germinação de M. linifera e que as sementes foram frequentemente destruídas durante o consumo, sugerimos que L. dorsalis tem um papel limitado como dispersor de sementes de M. linifera e, em vez disso, age como predador de sementes. No entanto, para a espécie E. oleracea, L. dorsalis foi um potencial dispersor, uma vez que o desempenho germinativo das sementes foi melhorado após a digestão. Além disso, o número de sementes consumidas foi diretamente proporcional ao tamanho corporal do bagre, reforçando o papel de doradídeos como potenciais dispersores de sementes em florestas tropicais.
Desconhecido
Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina
(American Society for Microbiology, 2011-11) CERDEIRA, Louise Teixeira; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; ALMEIDA, Sintia Silva de; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; ALI, Amjad; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; RAMOS, Rommel Thiago Juca; OLIVEIRA, Rodrigo Santos de; BARH, Debmalya; SHARMA, Neha Barve; ZAMBARE, Vasudeo; BELCHIOR, Silvia Estevão; GUIMARÃES, Luís Carlos; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; ROCHA, Flávia de Souza; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; TAUCH, Andreas; TROST, Eva; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; SILVA, Artur Luiz da Costa da
Desconhecido
Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp162, Isolated from Camel
(American Society for Microbiology, 2012) HASSAN, Syed Shah; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; RAMOS, Rommel Thiago Juca; CARNEIRO, Adriana Ribeiro; LIMA, Alex Ranieri Jerônimo; GUIMARÃES, Luís Carlos; ALI, Amjad; BAKHTIAR, Syeda Marriam; PEREIRA, Ulisses de Pádua; SANTOS, Anderson Rodrigues dos; SOARES, Siomar de Castro; DORELLA, Fernanda Alves; GOMIDE, Anne Cybelle Pinto; RIBEIRO, Dayana; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro; ALMEIDA, Sintia Silva de; ABREU, Vinicius Augusto Carvalho de; ABURJAILE, Flavia Figueira; NASCIMENTO, Karina Kelly Fiaux do; BARBOSA, Eudes Guilherme Vieira; DINIZ, Carlos Augusto Almeida; ROCHA, Flávia de Souza; SAXENA, Rashmi; TIWARI, Sandeep; ZAMBARE, Vasudeo; GHOSH, Preetam; PACHECO, Luis Gustavo Carvalho; DOWSON, Christopher G.; KUMAR, Anil; BARH, Debmalya; MIYOSHI, Anderson; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho; SILVA, Artur Luiz da Costa da

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