Navegando por Assunto "DNA mitocondrial"

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Alterações mitocondriais e tumorigênese de câncer gástrico em Sapajus apella
(Universidade Federal do Pará, 2018-06-15) ANTUNES, Symara Rodrigues; BORGES, Bárbara do Nascimento; http://lattes.cnpq.br/0676220027193876
Câncer é o nome dado a uma variedade de doenças que podem ocorrer em diferentes regiões do corpo, que se caracteriza principalmente pela proliferação desregulada de células. Uma organela muito importante, tanto em células normais quanto em células mutadas, é a mitocôndria, responsável pela maior parte da produção de ATP na célula. Mutações no DNA mitocondrial podem acarretar apoptose ou influenciar na eficiência da formação de ATP. Considerando diversas estimativas diferentes, o câncer gástrico sempre figura entre os cinco mais incidentes na população mundial, bem como na população brasileira e paraense. Dessa forma, entender o comportamento tumoral torna-se importante para o combate dessa patologia. O objetivo do trabalho, portanto, é analisar a presença de alterações no DNA mitocondrial de linhagens de carcinoma gástrico implantadas em um modelo animal. Foram analisados quatro genes mitocondriais (COI, ATPase 8, ND1 e ND3) de quatro linhagens de câncer gástrico (AGP01, ACP02, ACP03 e PG100) e uma controle (Carcinossarcoma 256 de Walker) para avaliar as possíveis mutações do DNA mitocondrial. Essas linhagens foram inoculadas em primatas não humanos da espécie Sapajus apella, sendo que alguns animais receberam concomitantemente com as linhagens a substância carcinogênica N-metil-N-nitrosurea (MNU). Os tumores gástricos que se desenvolveram nos animais foram retirados cirurgicamente, após isso foi feita a extração do DNA, amplificação e sequenciamento das sequencias de interesse. Foram observadas alterações nos genes ND1 e ND3. As duas transições encontradas em ND1, uma na posição 3594 (CT) e 3693 (GA) do DNA mitocondrial, não possuíam registro associado a nenhuma patologia, tendo sido relacionadas com marcadores populacionais. Os resultados sugerem que alterações nos genes codificadores de proteínas que participam do Complexo I da cadeia respiratória são mais frequentes que em outras porções do mtDNA nas linhagens de carcinoma gástrico analisadas.
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Análises moleculares da região controle do DNA mitocondrial de astrocitomas na população paraense
(Universidade Federal do Pará, 2012-06-06) COSTA JÚNIOR, Carlos Antonio da; ANSELMO, Nilson Praia; http://lattes.cnpq.br/6518287721873199
O câncer do sistema nervoso central representa 2% de todas as neoplasias malignas na população mundial e 23% dos casos de câncer infantil. No Brasil, estimam-se 4.820 casos deste câncer em homens e 4.450 em mulheres para o ano de 2012. Os gliomas são tumores do sistema nervoso central formados a partir de células da glia e somam mais de 70% do tumores cerebrais. A propriedade mais importante dos gliomas é sua capacidade de evasão imunológica. Idade, etnia, gênero e ocupação podem ser considerados fatores de risco para o surgimento de gliomas, e são duas vezes mais frequentes em afro-americanos. O astrocitoma é o tumor glial mais frequente, constituindo cerca de 75% dos casos de gliomas. Estes tumores são classificados em quatro graus, de acordo com a Organização Mundial de Saúde. O DNA mitocondrial está relacionado com o desenvolvimento e a progressão de vários tipos de tumores. A mitocôndria é responsável pelo balanço energético celular e está envolvida no disparo da apoptose em resposta ao estresse oxidativo. Mutações na D-LOOP podem alterar a taxa de replicação do DNA e aumentar o risco do desenvolvimento do câncer. Neste estudo foram analisadas 29 amostras de astrocitoma classificados de acordo com a OMS. Nossos dados sugerem que os astrocitomas de baixo grau podem estar relacionados à herança genética, tornando portadores de alguns polimorfismos ou mutações específicas, mais suscetíveis ao risco de desenvolver a doença, e os de alto grau podem estar relacionados à exposição prolongada aos agentes carginógenos. Foram identificados polimorfismos e mutações onde alguns apresentaram relação com o risco do desenvolvimento de astrocitomas e com a progressão da doença. A inserção de dois ou mais nucleotídeos nas regiões de microssatélites pode causar sua instabilidade e contribuir com o surgimento do câncer. A deleção no sítio 16132 pode ser um marcador para astrocitoma de alto grau, assim como a inserção de duas ou mais citosinas no sítio 16190 pode ser um marcador específico para astrocitomas. As mutações heteroplásmicas podem ser determinantes para o surgimento e/ou progressão de astrocitomas de alto grau.
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Aplicação de redes neurais artificiais na classificação de padrões filogeográficos com base na variabilidade genômica do DNA mitocondrial
(Universidade Federal do Pará, 2007-12-20) GOMES, Larissa Luz; SANTOS, Ândrea Kely Campos Ribeiro dos; http://lattes.cnpq.br/3899534338451625; OLIVEIRA, Roberto Célio Limão de; http://lattes.cnpq.br/4497607460894318
Historicamente, o processo de formação das populações da Amazônia, assim como de todo território brasileiro, envolveu três grupos étnicos principais: o ameríndio, o europeu e o africano. Como conseqüência, estas populações possuem em geral constituição miscigenada do ponto de vista social e biológico. Desde o final do século passado, estudos do DNA mitocondrial (mtDNA) tem sido desenvolvidos com o propósito de estimar a mistura interétnica presente nestas populações. Para isto, é de fundamental importância a classificação de uma determinada linhagem de mtDNA em um dos mais de 250 haplogrupos/subclados propostos na literatura. Com o objetivo de desenvolver um sistema automatizado, preciso e acurado de classificação de seqüências (linhagens) de mtDNA, o presente trabalhou lançou mão da técnica de Redes Neurais Artificiais (RNA’s) tendo como base os estudos de filogeografia. Para esta classificação, foram desenvolvidas quatro redes neurais artificiais diretas, com múltiplas camadas e algoritmo de aprendizagem de retropropagação. As entradas de cada rede equivalem às posições nucleotídicas polimórficas da região hipervariável do DNA mitocondrial, as quais retornam como saída a classificação específica de cada linhagem. Posterior ao treinamento, todas as redes apresentaram índices de acerto de 100%, demonstrando que a técnica de Rede Neural Artificial pode ser utilizada, com êxito, na classificação de padrões filogeográficos com base no DNA mitocondrial.
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Avaliação da integridade genômica mitocondrial em gliomas de alto e baixo grau na população paraense
(Universidade Federal do Pará, 2016-12-14) COSTA JÚNIOR, Carlos Antonio da; BORGES, Bárbara do Nascimento; http://lattes.cnpq.br/0676220027193876
O câncer se caracteriza pela a rápida proliferação de células anormais que crescem além dos seus limites habituais, podendo invadir partes adjacentes ou à distância. O câncer do SNC representa 2% de todas as neoplasias no mundo, sendo ligeiramente mais alta em homens que em mulheres. As mitocôndrias, responsáveis pela produção da maior parte do ATP celular através da oxidação fosforilativa (OXPHOS), pode também atuar através da glicólise com a mesma finalidade, não necessitando exclusivamente de oxigênio. Esta opção é característica das células cancerosas, conhecida como efeito Warburg. Uma hipótese para explicar essa alteração metabólica pode estar relacionada aos defeitos no DNA mitocondrial (mtDNA) causados pela OXPHOS, onde essas mutações podem induzir as células cancerosas à glicólise. Foram analisadas oito regiões do mtDNA (D-LOOP, ND1, ND3, CO I, CO II, CO III, ATPase 6 e ATPase 8) em tecidos neoplásicos de pacientes acometidos por câncer de células da glia na população paraense, relacionando os dados obtidos com as características clínicas e patológicas dos pacientes. Dentre as alterações encontradas, as do complexo I parecer ser determinantes para a progressão dos tumores de alto grau, assim como, as alterações indel parecem comprometer estruturas importantes para a OXPHOS. As deleções 4977 pb, quando associadas a outras alterações no ND1/ND3 ou a heteroplasmias, sugerem mau prognostico, porém, parecem ter uma redução no risco quando as alterações nos ND1 e ND3 são simultâneas.
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Can Lutjanus purpureus (South red snapper) be "legally" considered a red snapper (Lutjanus campechanus)?
(2008) GOMES, Grazielle Fernanda Evangelista; SCHNEIDER, Horacio; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; SILVA, Simoni Santos da; ORTI, Guillermo; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
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Genetic characterization of native and introduced populations of the neotropical cichlid genus Cichla in Brazil
(2009) CARVALHO, Daniel Cardoso de; OLIVEIRA, Denise Aparecida Andrade de; SANTOS, José Enemir dos; TESKE, Peter; BEHEREGARAY, Luciano Bellagamba; SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
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Genetic differentiation in populations of Aedes aegypti (Diptera, Culicidae) dengue vector from the Brazilian state of Maranhão
(Universidade Federal do Pará, 2017-03) SOUSA, Andrelina Alves de; FRAGA, Elmary da Costa; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio; BARROS, Maria Claudene
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Genetic differentiation of Macrodon ancylodon (Sciaenidae, Perciformes) populations in Atlantic coastal waters of South America as revealed by mtDNA analysis
(2003) SILVA, Simoni Santos da; SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
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Genetic variation in native and farmed populations of Tambaqui (Colossoma macropomum) in the Brazilian Amazon: regional discrepancies in farming systems
(2013) AGUIAR, Jonas da Paz; SCHNEIDER, Horacio; GOMES, Maria de Fátima; CARNEIRO, Jeferson Costa; SILVA, Simoni Santos da; RODRIGUES, Luis Reginaldo Ribeiro; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
O tambaqui, Colossoma macropomum, é a espécie de peixes mais popularmente usada para a aquicultura no Brasil, mas não há nenhum estudo comparando a variação genética entre as populações nativas e de cultivo desta espécie. No presente estudo foram analisadas sequências de DNA mitocondrial para avaliar a diversidade genética entre duas populações selvagens, um plantel de produção de alevinos, e uma amostra de estoques de piscicultura, todos da região de Santarém, no oeste do estado do Pará. Níveis similares de diversidade genética foram encontrados em todas as amostras e, surpreendentemente, o plantel mostrou expressiva representação da diversidade genética registrada em populações selvagens. Estes resultados contrastam consideravelmente com os do estudo anterior de estoques cultivados nos estados do Amapá, Pará, Piauí, Rondônia, que registrou apenas dois haplótipos, indicando uma longa história de endogamia nas matrizes utilizadas para a produção de alevinos. Os resultados dos dois estudos mostram dois cenários distintos de aquicultura do tambaqui na Amazônia, que devem ser melhor avaliados, a fim de garantir o sucesso da expansão da atividade na região, e no resto do Brasil, já que o tambaqui e seus híbridos agora são cultivados em todo o país.
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Identification and phylogenetic inferences on stocks of sharks affected by the fishing industry off the Northern coast of Brazil
(2009) RODRIGUES-FILHO, Luis Fernando da Silva; ROCHA, Tainá Carreira da; RÊGO, Péricles Sena do; SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de
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Inclusion of South American samples reveals new population structuring of the blacktip shark (Carcharhinus limbatus) in the western Atlantic
(2012-10-09) SODRE, Davidson; RODRIGUES-FILHO, Luis Fernando da Silva; SOUZA, Rosália Furtado Cutrim; RÊGO, Péricles Sena do; SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de
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Innovative molecular approach to the identification of Colossoma macropomum and its hybrids
(2012-06) CUNHA, Maria de Fátima Gomes; SCHNEIDER, Horacio; BARROS, Maria Claudene; SAMPAIO, Dioniso de Souza; HASHIMOTO, Diogo Teruo; PORTO-FORESTI, Fábio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
O Tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie de peixe mais comumente cultivada em pisciculturas no Brasil. A espécie é altamente adaptada às condições de cativeiro, apresentando rápido crescimento e alta fecundidade. Nos últimos anos tem ocorrido o cruzamento artificial entre espécies de Characiformes, produzindo os híbridos "Tambacu" e "Tambatinga". A identificação de híbridos é uma tarefa difícil, em virtude da grande similaridade morfológica entre as espécies parentais. O presente estudo apresenta uma abordagem molecular inovadora para identificação de híbridos com base em PCR Multiplex de um gene nuclear (α-Tropomiosina), em que foram testados 93 espécimes obtidos em pisciculturas da região norte do Brasil. O sequenciamento de um fragmento de 505 pares de bases da Região Controle permitiu a identificação da linhagem materna de todos os espécimes como sendo de C. macropomum. Inesperadamente foram encontrados apenas dois haplótipos nas 93 amostras, um baixíssimo índice de diversidade para populações cultivadas de Tambaqui. A PCR multiplex identificou 42 híbridos, em contraste aos 23 híbridos citados pelos fornecedores dos peixes, em uma identificação realizada com base na morfologia. Esta ferramenta inovadora possui um grande potencial para o desenvolvimento da aquicultura brasileira dada a possibilidade de identificação sistemática das características genéticas tanto das matrizes produtoras de alevinos quanto dos alevinos e juvenis criados em fazendas.
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Low levels of genetic diversity depicted from mitochondrial DNA sequences in a heavily exploited marine fish (Cynoscion acoupa, Sciaenidae) from the Northern coast of Brazil
(2008) RODRIGUES, Rosa Maria da Silva; SCHNEIDER, Horacio; SILVA, Simoni Santos da; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; SAINT-PAUL, Ulrich; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
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Mitochondrial DNA mapping of social-biological interactions in Brazilian Amazonian African-descendant populations
(2008) CARVALHO, Bruno Maia; BORTOLINI, Maria Cátira; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; SANTOS, Ândrea Kely Campos Ribeiro dos
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Mitochondrial DNA-like sequence in the nuclear genome of Saguinus (Callitrichinae, Primates): transfer estimation
(2000-03) SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; SENA, Leonardo dos Santos; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz
Seqüências tipo mitocondriais têm comumente sido encontradas no genoma nuclear de diversos organismos. Quando acidentalmente incluídas em estudos de seqüências mitocondriais, diversas conclusões errôneas podem ser obtidas. No entanto, estes pseudogenes nucleares tipo mitocondriais podem ser usados para a estimativa da taxa relativa de evolução de genes mitocondriais e também como grupo externo em análises filogenéticas. No presente trabalho, seqüências mitocondriais com características do tipo de pseudogene, tais como deleções e/ou inserções e códons de parada, foram encontradas em tamarins (Saguinus spp., Callitrichinae, Primates). A análise filogenética permitiu a estimativa do tempo da migração da seqüência mitocondrial para o genoma nuclear e algumas inferências filogenéticas. A escolha de um grupo externo não adequado (Aotus infulatus) não permitiu uma reconstrução filogenética confiável da subfamília Callitrichinae. A divergência bastante antiga de Cebidae (Callitrichinae, Aotinae e Cebinae) pode ter favorecido o aparecimento de homoplasias, obscurecendo a análise.
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Molecular discrimination of pouched four-eyed opossums from the Mamirauá Reserve in the Brazilian Amazon
(2006) NUNES, Cláudia; AYRES, José Márcio Corrêa; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio
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Novel 12S mtDNA findings in sloths (Pilosa, Folivora) and anteaters (Pilosa, Vermilingua) suggest a true case of long branch attraction
(2008) BARROS, Maria Claudene; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio
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Phylogenetic analysis of 16S mitochondrial DNA data in sloths and anteaters
(2003) BARROS, Maria Claudene; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio
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Population analysis of Scomberomorus cavalla (Cuvier, 1829) (Perciformes, Scombridae) from the Northern and Northeastern coast of Brazil
(2007) SANTA BRÍGIDA, Erikson Luiz; CUNHA, Divino Bruno da; RÊGO, Péricles Sena do; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha; SCHNEIDER, Horacio; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de
Scomberomorus cavalla é uma espécie de peixe pelágico amplamente distribuído na costa oeste do Atlântico, e uma diminuição no seu nível de captura tem sido verificada nos E.U.A e Golfo do México, comparada com os níveis alcançados pela espécie no passado. Da mesma forma, em algumas áreas do Brasil, há indícios de sobre-exploração. Entretanto, não existem estudos moleculares que visam o manejo deste importante item. Desta forma, no presente estudo, foram seqüenciados 380 pares de bases nucleotídicas da região da Alça-D do DNA mitocondrial de amostras provenientes de desembarque em Macapá, Bragança e Fortaleza. As análises filogenéticas e populacionais revelaram que há apenas uma população panmítica e baixos níveis de variabilidade genética foram observados. Estes resultados, assim como a observada sobre-exploração de S. cavala, representam dados muito importantes para o estabelecimento do manejo deste estoque a fim de prevenir um colapso ou risco de extinção no futuro.
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Sciaenidae fish of the Caeté River estuary, Northern Brazil: mitochondrial DNA suggests explosive radiation for the Western Atlantic assemblage
(2004) VINSON, Christina Cleo; GOMES, Grazielle Fernanda Evangelista; SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha