Mitochondrial DNA-like sequence in the nuclear genome of Saguinus (Callitrichinae, Primates): transfer estimation

dc.creatorSOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de
dc.creatorSENA, Leonardo dos Santos
dc.creatorSAMPAIO, Maria Iracilda da Cunha
dc.creatorSCHNEIDER, Horacio
dc.creatorSCHNEIDER, Maria Paula Cruz
dc.date.accessioned2011-05-12T14:53:46Z
dc.date.available2011-05-12T14:53:46Z
dc.date.issued2000-03
dc.description.abstractMitochondrial DNA-like sequences have been found in the nuclei of a variety of organisms. These nuclear pseudogenes can be used to estimate relative evolutionary rates of mitochondrial genes, and can be used as outgroups in phylogenetic analyses. In this study, mitochondrial sequences with pseudogene-like characteristics, including deletions and/or insertions and stop codons, were found in tamarins (Saguinus spp., Callitrichinae, Primates). Phylogenetic analysis allowed estimation of the timing of the migration of these sequences to the nuclear genome, and also permitted inferences on the phylogeny of the genus. The choice of an inadequate outgroup (Aotus infulatus) prevented a good phylogenetic resolution of the subfamily Callitrichinae. The relatively ancient divergence of the Cebidae (Callitrichinae, Aotinae and Cebinae) may have favored confounding homoplasies.pt_BR
dc.description.resumoSeqüências tipo mitocondriais têm comumente sido encontradas no genoma nuclear de diversos organismos. Quando acidentalmente incluídas em estudos de seqüências mitocondriais, diversas conclusões errôneas podem ser obtidas. No entanto, estes pseudogenes nucleares tipo mitocondriais podem ser usados para a estimativa da taxa relativa de evolução de genes mitocondriais e também como grupo externo em análises filogenéticas. No presente trabalho, seqüências mitocondriais com características do tipo de pseudogene, tais como deleções e/ou inserções e códons de parada, foram encontradas em tamarins (Saguinus spp., Callitrichinae, Primates). A análise filogenética permitiu a estimativa do tempo da migração da seqüência mitocondrial para o genoma nuclear e algumas inferências filogenéticas. A escolha de um grupo externo não adequado (Aotus infulatus) não permitiu uma reconstrução filogenética confiável da subfamília Callitrichinae. A divergência bastante antiga de Cebidae (Callitrichinae, Aotinae e Cebinae) pode ter favorecido o aparecimento de homoplasias, obscurecendo a análise.pt_BR
dc.identifier.citationVALLINOTO, Marcelo et al. Mitochondrial DNA-like sequence in the nuclear genome of Saguinus (Callitrichinae, Primates): transfer estimation. Genetics and Molecular Biology, online, v. 23, n. 1, p. 35-42, mar. 2000. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/S1415-47572000000100006. Disponível em: http://www.repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/2181. Acesso em:.pt_BR
dc.identifier.doi10.1590/S1415-47572000000100006
dc.identifier.issn1415-4757
dc.identifier.urihttp://www.repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/2181
dc.language.isoengpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectFilogeniapt_BR
dc.subjectDNA mitocondrialpt_BR
dc.subjectSaguinuspt_BR
dc.titleMitochondrial DNA-like sequence in the nuclear genome of Saguinus (Callitrichinae, Primates): transfer estimationpt_BR
dc.typeArtigo de Periódicopt_BR

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