Please use this identifier to cite or link to this item: http://repositorio.ufpa.br:8080/jspui/handle/2011/6319
metadata.dc.type: Artigo de Periódico
Issue Date: Dec-2013
metadata.dc.creator: MOURA, Elisa Ferreira
FARIAS NETO, João Tomé de
SAMPAIO, José Edson
SILVA, Diehgo Tuloza da
RAMALHO, Girena Fernandes
metadata.dc.creator.ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4295-4676
metadata.dc.description.affiliation: SILVA, D. T. Universidade Federal do Pará
Title: Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers
Other Titles: Identificação de duplicatas em acessos de mandioca coletados na Região Norte do Brasil por meio de marcadores microssatélites
metadata.dc.description.sponsorship: FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas
CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
EMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária
Citation: MOURA, Elisa Ferreira et al. Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers. Acta Amazonica, Manaus, v. 43, n. 4, p. 461-467, dez. 2013. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/S0044-59672013000400008. Disponível em: http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/6319. Acesso em:.
metadata.dc.description.resumo: Duplicatas costumam ocorrer em bancos de germoplasma e a sua identificação é necessária para facilitar o manejo dos bancos ativos de germoplasma (BAGs) e diminuir custos de manutenção. O objetivo deste trabalho foi identificar duplicatas de mandioca determinadas previamente pela caracterização morfo-agronômica, em um BAG da Amazônia Oriental. Foram selecionados 36 acessos que se agrupavam em 13 grupos de similaridade morfo-agronômica para serem genotipados com 15 locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, sendo obtidos 75 alelos, com média de cinco alelos por loco e HE = 0,66. Foram encontrados 34 pares de genótipos que apresentaram perfis multilocos idênticos e a probabilidade de identidade genética foi de 1,1x10-12 com probabilidade de exclusão de 99,9999%. Entre essas duplicatas, estão materiais coletados em épocas e locais diferentes, e com diferentes denominações e acessos com o mesmo nome coletados em diferentes locais e anos. O estudo identificou genótipos que vem sendo cultivados em diferentes locais e que vêm sendo mantidos pelos agricultores ao longo dos anos.
Abstract: Duplicates are common in germplasm banks and their identification is needed to facilitate germplasm bank management and to reduce maintenance costs. The aim of this work was to identify duplicates of cassava from a germplasm bank in Eastern Amazon, which had been previously characterized both morphological and agronomically. In order to be genotyped with 15 microsatellite loci, 36 accessions were selected. These accessions were classified into 13 groups of similar morpho-agronomical characteristics. All loci were polymorphic, and 75 alleles were identified, with an average of five alleles per loci and HE = 0.66. There were determined 34 pairs of genotypes with identical multiloci profiles and the probability of genetic identity was 1.1x10-12 with probability of exclusion of 99.9999%. Among these duplicates, there are accessions sampled on different years and places, but with different names and accessions with the same name sampled in different places and years. The study identified genotypes that are grown in different places and that have been maintained over the years by local farmers.
Keywords: Manihot esculenta
Germoplasma
Marcadores moleculares
Germplasm
Molecular markers
Series/Report no.: Acta Amazonica
ISSN: 1809-4392
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia
metadata.dc.publisher.initials: INPA
metadata.dc.rights: Acesso Aberto
metadata.dc.source.uri: http://ref.scielo.org/vxsd5y
metadata.dc.identifier.doi: http://dx.doi.org/10.1590/S0044-59672013000400008
Appears in Collections:Artigos Científicos - ICB

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Article_IdentificationDuplicatesCassava.pdf453,63 kBAdobe PDFView/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons