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dc.creatorPADILHA, Marcos Daniel Mendes-
dc.date.accessioned2023-09-21T14:49:26Z-
dc.date.available2023-09-21T14:49:26Z-
dc.date.issued2023-09-
dc.identifier.citationPADILHA, Marcos Daniel Mendes. Obtenção de genomas bacterianos a partir de dados metagenomicos da usina hidrelétrica de Tucuruí. Orientador: Diego Assis das Graças. 2023. 102 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, 2023. Disponível em: https://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/15934. Acesso em:.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/15934-
dc.description.abstractTucuruí is the second largest Brazilian Hydroelectric Power Plant, the artificial lake in the municipality of Tucuruí has altered the ecosystem of the region. Many free-living microorganisms responsible for biomass degradation, organic matter decomposition, biogeochemical cycles, some of clinical interest, are adapted to live in the lake reservoir. This research aims to obtain bacterial genomes by metagenomic data and identify functional profiles and microbial metabolisms in the lake. Water and sediment samples were collected in the lake of the Tucuruí Hydroelectric Power Plant in the photic, aphotic and sedimentary layers of the station upstream of the new division. After filtering through a nitrocellulose membrane, the DNA samples were extracted. Total metagenome sequencing was performed on the Ion ProtonTM platform. Megahit was used to assemble the metagenomes. ORFs were predicted using Prodigal and BUSCO was used for the quantification of completeness metrics for comparative evaluation of single-copy universal orthologues. Genomes assembled into metagenomes were classified in the databases. The phyla were defined at the genus and species level, where a diverse and extremely conserved microbiota was found. The functional profile of the metagenomes found corroborated with other studies of metagenomes of oligotrophic lakes, demonstrating high biochemical, conserved and diverse activity, being a pioneering study when assembling the first metagenomes of samples from the Tucuruí Hydroelectric Power Plant.pt_BR
dc.description.provenanceSubmitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2023-09-21T14:48:51Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM GENÉTICA E BIOLOGIA MOLECULAR-mesclado-1.pdf: 7595312 bytes, checksum: 987544256e28fda1f0360a1c80330848 (MD5) license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)en
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2023-09-21T14:49:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM GENÉTICA E BIOLOGIA MOLECULAR-mesclado-1.pdf: 7595312 bytes, checksum: 987544256e28fda1f0360a1c80330848 (MD5) license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)en
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dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicopt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Parápt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.sourcebibbiologicas@ufpa.brpt_BR
dc.subjectMicro-organismos - adaptaçãopt_BR
dc.subjectMicro-organismos - genéticapt_BR
dc.subjectSedimentos lacustrespt_BR
dc.subjectEcologia de água docept_BR
dc.subjectGenomicapt_BR
dc.subjectMetagenomapt_BR
dc.subjectTucuruí - PApt_BR
dc.subjectUsina Hidrelétrica de Tucuruí - PApt_BR
dc.titleObtenção de genomas bacterianos a partir de dados metagenômicos da usina hidrelétrica de Tucuruípt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicaspt_BR
dc.publisher.initialsUFPApt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA::ECOLOGIA DE ECOSSISTEMASpt_BR
dc.contributor.advisor1GRAÇAS, Diego Assis das-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1945468865634432pt_BR
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/7402939637915735pt_BR
dc.description.resumoTucuruí é a segunda maior Usina Hidrelétrica brasileira, o lago artificial no município de Tucuruí alterou o ecossistema da região. Muitos microrganismos de vida livre responsáveis pela degradação de biomassa, decomposição de matéria orgânica, ciclos biogeoquímicos, alguns de interesse clínico, estão adaptados para viver no reservatório do lago. Esta pesquisa tem por objetivo a obtenção de genomas bacterianos por dados metagenômicos e identificar perfis funcionais e metabolismos microbianos no lago. Amostras de água e sedimento foram coletadas no lago da Usina Hidrelétrica de Tucuruí nas camadas fótica, afótica e sedimentar da estação do montante do novo repartimento. Após a filtração em membrana de nitrocelulose as amostras de DNA foram extraídas. O sequenciamento de metagenoma total foi realizado na plataforma Ion ProtonTM. Utilizou-se o Megahit para a montagem dos metagenomas. ORFs foram previstas usando Prodigal e foi usado o BUSCO para as quantificações de métricas de completude para avaliação comparativa de ortólogos universais de cópia única. Os genomas montados em metagenomas foram classificados nos banco de dados. Os filos foram definidos em nível de gênero e espécie, onde foi encontrado uma microbiota diversa e extremamente conservada. O perfil funcional dos metagenomas encontrados corroborou com outros estudos de metagenomas de lagos oligotróficos, demonstrando alta atividade bioquímica, conservada e diversa, sendo um estudo pioneiro ao montar os primeiros metagenomas de amostras da Usina Hidrelétrica de Tucuruí.pt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.subject.linhadepesquisaGENÉTICA MOLECULAR E DE MICRO-ORGANISMOSpt_BR
dc.subject.areadeconcentracaoGenéticapt_BR
dc.creator.ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-2829-4819pt_BR
dc.contributor.advisor1ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-5059-4316pt_BR
Aparece nas coleções:Dissertações em Genética e Biologia Molecular (Mestrado) - PPGBM/ICB

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