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Tipo: Dissertação
Data do documento: 28-Fev-2020
Autor(es): SANCHES, Vitor Hugo da SIlva
Primeiro(a) Orientador(a): SANTOS, Cleydson Breno Rodrigues dos
Título: Desenvolvimento de candidatos a fármacos para tratamento da Leucemia Mielóide Crônica a partir do Imatinibe
Citar como: SANCHES, Vitor Hugo da SIlva. Desenvolvimento de candidatos a fármacos para tratamento da Leucemia Mielóide Crônica a partir do Imatinibe. Orientador: Cleydson Breno Rodrigues dos Santos. 2020. 53 f. Dissertação (Mestrado em Química Medicinal e Modelagem Molecular) - Instituto de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Pará, Belém, 2020. Disponível em:http://repositorio.ufpa.br:8080/jspui/handle/2011/14684. Acesso em:.
Resumo: A Leucemia Mielóide Crônica (LMC) é uma doença mieloproliferativa crônica clonal, caracterizada por leucocitose com desvio à esquerda, esplenomegalia e pela presença do cromossomo Philadelphia (Ph), que resulta da translocação recíproca e equilibrada entre os braços longos dos cromossomos 9q34 e 22q11, gerando a proteína híbrida BCR-ABL, com atividade aumentada de tirosina quinase. Assim, realizou-se um estudo de triagem virtual baseado no ligante Imatinibe, com pose cristalográfica definida, depositada sob código PDB ID 1IEP. Foram utilizadas seis bases de dados comercias para seleção de moléculas, por meio do software ROCS (similaridade por forma) e EON (similaridade eletrostática), seguidas de predição farmacocinéticas e toxicológicas in silico, resultando em 9 estruturas com valores satisfatórios, comparados com o Imatinibe, que foram submetidas a estudo de predição de atividade biológica via servidor online PASS Prediction, resultando em duas estruturas com valores de Probabilidade de ser “ativo” (Pa) para atividade de inibição a proteína quinase, sendo as moléculas LMQC01 (Pa= 0,457) e LMQC04 (Pa= 0,658), selecionadas para estudo de docking molecular. Utilizou-se a interface gráfica Pyrx 0.8, para avaliar as prováveis interações com os resíduos de aminoácidos e a afinidade de ligação as estruturas com o sítio ativo BCR-ABL, resultando em -8.6Kcal/mol-1 para a estrutura LMQC01 e -12.2Kcal/mol-1 para LMQC04, sendo que a estrutura LMQC04 alcançou valor superior a afinidade de ligação experimental do imatinibe (-11.18Kcal/mol-1), sendo este selecionado como fármaco promissor para estudos posteriores.
Abstract: Chronic Myeloid Leukemia (CML) is a chronic clonal myeloproliferative disease, characterized by leukocytosis with left shift, splenomegaly and the presence of the Philadelphia (Ph) chromosome, which results from the reciprocal and balanced translocation between the advanced states of chromosomes 9q34 and 22q11, generating a hybrid protein BCR-ABL, with increased activity of tyrosine kinase. Thus, it carried out a virtual screening study based on the ligand Imatinib, with a defined crystallographic pose, deposited under the code PDB ID 1IEP. Six databases of merchants were used to select molecules, using the software ROCS (shape similarity) and EON (electrostatic similarity), followed by pharmacokinetic and toxicological predictions in silicon, resulting in 9 methods with satisfactory values, compared with Imatinib , which were submitted to a study of biological activity prediction via PASS Prediction online server, resulting in two structures with Probability of being "active" (Pa) values for protein kinase inhibition activity, such as LMQC01 molecules (Pa = 0.457) and LMQC04 (Pa = 0.658), selected for the study of molecular docking. Use a Pyrx 0.8 graphical interface, to evaluate as likely interactions with amino acid residues and binding affinity as structures with the BCR-ABL active site, resulting in -8.6Kcal / mol-1 for structure LMQC01 and -12.2Kcal / mol -1 for LMQC04, with the LMQC04 structure reaching a value higher than the experimental binding affinity of imatinib (-11.18Kcal / mol-1), being the one selected as a drug promoter for further studies.
Palavras-chave: LMC
Imatinibe
1IEP
Tirosina quinase
Atividade biológica
Imatinib
Tyrosine kinase
Biological activity
Área de Concentração: MODELAGEM MOLECULAR
Linha de Pesquisa: MODELAGEM MOLECULAR E SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL DE SISTEMAS BIOMOLECULARES
CNPq: CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA::QUIMICA MODULAR
País: Brasil
Instituição: Universidade Federal do Pará
Sigla da Instituição: UFPA
Instituto: Instituto de Ciências da Saúde
Programa: Programa de Pós-Graduação em Química Medicinal e Modelagem Molecular
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
Fonte URI: Disponível na internet via correio eletrônico: bibsaude@ufpa.br
Aparece nas coleções:Dissertações em Química Medicinal e Modelagem Molecular (Mestrado) - PPGQMMM/ICS

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