O atual Instituto Amazônico de Agriculturas Familiares (INEAF) teve sua criação e funcionamento a partir do Núcleo de Ciências Agrárias e Desenvolvimento Rural (NCADR) sendo aprovado pelo CONSUN no dia 09 de outubro de 2007. A estrutura acadêmico-administrativa foi instituída pela Portaria Nº 942 de 19 de março de 2008, publicada na folha 11 da Seção 1 no D.O.U. Nº 55 no dia 20 de março de 2008. O NCADR sucedeu o Centro Agropecuário (CA) em decorrência das mudanças regimentais ocorridas na UFPa a partir de 2007. O antigo Centro Agropecuário iniciou suas atividades em 1991 com o curso de Especialização em Agriculturas Familiares Amazônicas e Desenvolvimento Ambiental (DAZ), sediado no NAEA (Núcleo de Altos Estudos Amazônicos) e com o curso de Mestrado em Ciência Animal e a criação da CEBRAN[1] (Central de Biotecnologia da Reprodução Animal), ambos ligados ao antigo Centro de Biologia. Em 1994 foi formalizado dentro da instituição enquanto Unidade Acadêmico-administrativa sendo constituído por duas subunidades com característica de núcleos de integração: O Núcleo de Estudos Integrados sobre Agricultura Familiar (NEAF) e o Núcleo de Estudos em Ciência Animal (NECAN). Essas duas subunidades deram origem aos dois Programas de Pós-Graduação (PPGAA e PPGCAN) sob a responsabilidade do NCADR.